Положено ли единовременное пособие при рождении ребенка если родился не в рф (мама и папа граждане рф).

Отказ правомерный. у загса в рф такой справки нет и быть не может, если вы ее не представляли и представить не могли потому, что рожали не в рф.
не знаю в какой стране вы родили ребенка, но после рождения ребенка в роддоме или больнице вам должны были дать справку о рождении (в разных странах она может быть разной формы), где должна быть вся информация о ребенке: когда и где он родился, кто его родители, как назвали и т. п.
после возвращения в рф вы должны были сделать перевод проставить на ней апостиль (если требуется) и подать в женскую консультацию по месту жительства в рф, чтобы оформить "декрет" и получить положенные вам пособия в связи с рождением ребенка. находите возможность получить справку по месту рождения ребенка. удачи!
странно, что все это вам не объяснили...